Seleksi TPA untuk calon mahasiswa adalah dilakukan oleh Pasca Sarjana USU sedangkan untuk tes wawancara dilanjutkan di Program Studi Ilmu Kedokteran Tropis.
Adapun tahapan seleksi ini setelah melakukan penilaian terhadap hal-hal sebagai berikut:

1. Kelengkapan persyaratan pendaftaran
2. Kemampuan Akademik
3. Kesesuaian bidang ilmu calon mahasiswa dengan program yang diinginkan.
4. Materi seleksi yang diujikan pada Program Magister Ilmu Kedokteran Tropis mencakup Tes Potensi Akademik (TPA).
5. Bahasa Inggris dengan nilai TOEFL minimal 500.
6. Wawancara calon mahasiswa yang akan diterima dilakukan setelah selesai ujian TPA.